Profil lulusan program studi S1 Farmasi Stikes Muhammadiyah Cirebon mengacu pada Peraturan Pemerintah No. 51 tahun 2009 yang menyatakan bahwa lulusan S1 Farmasi akan berperan sebagai tenaga teknis kefarmasiaan yang mampu menjalankan pekerjaan kefarmasian yaitu: pembuatan termasuk pengendalian mutu sediaan farmasi, pengamanan, pengadaan, penyimpanan, dan pendistribusian atau penyaluran obat, pengelolaan obat, pelaynan obat atas resep dokter,pelayanan informasi obat, serta pengembangan obat, bahan obat dan obat tradisional. Selain itu profil lulusan program studi S1 farmasi harus dapat berperan sebagaimana yang telah digariskan oleh WHO (World Health Organization) yang dikenal dengan istilah Eight Star Pharmacist yang meliputi:

1. Care giver, farmasi sebagai pemberi layanan dalam bentuk pelayanan klinis,analitis,teknis, sesuai peraturan perundang-undangan.
2. Decision maker, Farmasisi sebagai pengambil keputusan.
3. Communicator, Farmasis harus memiliki kemampuan berkomunikasi yang cukup baik dengan pasien, teman sejawat maupun profesi kesehatan lain.
4. Leader, Farmasis diharapkan memiliki kemampuan sebagai pemimpin.
5. Manager, Farmasis harus selektif dalam mengelola sumber daya (manusia,fisik,anggran) dan informasi, juga harus dapat dipimpin dan memimpin orang lain dalam tim kesehatan.
6. Life long leaner, Farmasis harus selalu melakukan up date keilmuan sejalan dengan perkembangan ipteks.
7. Teacher, Farmasis mempunyai tanggung jawab untuk mendidik dan melatih Farmasis generasi mendatang ataupun masyarakat dalam bidang kesehatan.
8. Reseacher, Farmasis diharapkan mampu melakukan dan mengembangkan penelitian dalam bidang kesehatan.

Acuan ketiga untuk merumuskan profil lulusan adalah tujuan pendidikan Stikes Muhammadiyah Cirebon yaitu:

1. Mendidik peserta didik untuk menjadi sarjana muslim yang beriman dan bertaqwa, berakhlaq mulia, yang mempunyai kemampuan akademik,profesional dan beramal menuju terwujudnya masyarakat Islam yang sebener-benarnya.
2. Membuat peserta didik menjadi kader pemimpin yang berkepribadian Muhammadiyah.
3. Mengembangkan dan menyebarluaskan ilmu pengetahuan, teknologi dan kesenian dalam rangka memajukan Islam dan meningkatkan kesejahteraan umat manusia. Berdasarkan ketiga hal tersebut, maka profil lulusan program studi S1 Farmasi Stikes Muhammadiyah Cirebon dirumuskan sebagai:Farmasis yang menjalankan peran eight star pharmacist yang berjiwa Muhammadiyah.